向高手们请教关于linux的局域网权限设置相关

童话天使

话说在服务器方面，linux是全能的，有些问题想向大家请教。
    假如说是在企业环境，有服务器，当然也有员工的机器。当然，在中国的环境下，员工的电脑不是xp就是win7.服务器的话，如果是win2003或者是win2008 的话，权限相关的也好说，整个域就一切都简单了。
    如果服务器是linux的，那么权限怎么设置。服务器不止一台，运行的samba啊nfs啊什么的，员工电脑都是windows的，这个权限怎么设置。linux系统怎么设置，才能代替win的域，或者说怎么做才能比域更好。
    我觉得这样问的话问题还不够变态，我们再来稍微变态一点点。
    在员工机器中，个别人比较特殊，偏爱用linux系统，服务器的话，因为有个别需求，服务器中有一台win2003的机器，至于是做什么的，就没必要说了，因为这个win2003的机器本来就是假想填上去的。
    好吧，环境就是这样了，相互之间怎么设置权限问题。
    期待能人志士，高人牛人神人前来指教。
    多谢大家了！