根据相同列查找某一行

明瞳狐狸

回复 5# klainogn
恩，经过实践，你的脚本是对的，谢谢~

   

明瞳狐狸

回复 6# love_shift
我试了，可是没有结果，这是为什么？

   

klainogn

我有点想不明白的是为什么这里会有那么多搞生物的，全都是各种很的难度的文件处理回复 7# Herowinter


   

lifayi2008

1. awk 'NR==FNR{a[$2]=$0}NR>FNR{FS=",";if($3 in a)print a[$3]}' b.txt c.txt

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把你的两个文件位置调换一下可以这样写，另外2楼说的是正确的

lifayi2008

awk 'NR==FNR{FS=","}{a[$3]=0}NR>FNR{FS="\t"}{if ($2 in a){print $0}}'  file1 file2
你想让NR==FNR对{FS=","}{a[$3]=0} 起作用的话 应该用大括号括起来 或者 写成这样{FS=",";a[$3]=0}  结果不对是因为第二次更改FS后到处理下一行时候才会生效

明瞳狐狸

回复 15# lifayi2008

哦，那怎么才能把第一行也包含进来呢？
   

lifayi2008

那种写法的话 我也没办法  不过可以变通一下处理

1. root@ubuntu14:~/test# cat b.txt
   
2. chr1    16877405        .       G       A         ...   
   
3. chr1    16910063        rs3872319       C       T          ...
   
4. chr1    16950470        rs12144467      C       T       ...
   
5. root@ubuntu14:~/test# cat c.txt
   
6. fam1,chr1,16950470,0.833266667007005
   
7. fam1,chr1,16877405,0.684558404931228
   
8. fam1,chr1,103427994,0.48393638491905
   
9. fam1,chr1,111863039,0.980521031104692
   
10. root@ubuntu14:~/test# awk 'NR==FNR{split($0,a,",");b[a[3]]}NR>FNR{if($2 in b)print $0}' c.txt b.txt
    
11. chr1    16877405        .       G       A         ...   
    
12. chr1    16950470        rs12144467      C       T       ...

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回复 16# 明瞳狐狸


   

明瞳狐狸

回复 17# lifayi2008
恩，好了，出来了。谢谢你这么耐心的回答。