awk文本提取与转换

mswsg

文件a.txt

1. 第一列        第二列
   
2. SNP1        0
   
3. SNP2        10.778
   
4. SNP3        10.778
   
5. SNP4        10.778
   
6. SNP5        50.668
   
7. SNP6        51.778
   
8. SNP7        60.888
   
9. SNP8        60.888
   
10. SNP9        60.888
    
11. SNP10        60.888
    
12. SNP11        60.888
    
13. SNP12        100.002
    
14. SNP13        100.002
    
15. SNP14        100.002
    
16. SNP15        111.2

复制代码

文件b.txt

1. 第一列        第二列        第三列
   
2. SNP1        0        0.5
   
3. SNP2        10.778        0.5
   
4. SNP5        50.668        2
   
5. SNP6        51.778        2.5
   
6. SNP9        60.888        3

复制代码

根据文件b中第二列的信息，如果和第二列的数字相同，相同则在下一行打印出
结果文件

1. 第一列        第二列        第三列
   
2. SNP1        0        0.5
   
3. SNP2        10.778        0.5
   
4. SNP3        10.778        0
   
5. SNP4        10.778        0
   
6. SNP5        50.668        2
   
7. SNP6        51.778        2.5
   
8. SNP9        60.888        3
   
9. SNP7        60.888        0
   
10. SNP8        60.888        0
    
11. SNP10        60.888        0
    
12. SNP11        60.888        0

复制代码

jason680

回复 1# mswsg

$ awk -vOFS="\t" 'FNR==NR{a[$1,$2]=$3;e[$2]=1;next}{if(e[$2])print $0,(a[$1,$2])?a[$1,$2]:0}' b.txt  a.txt
第一列        第二列        第三列
SNP1        0        0.5
SNP2        10.778        0.5
SNP3        10.778        0
SNP4        10.778        0
SNP5        50.668        2
SNP6        51.778        2.5
SNP7        60.888        0
SNP8        60.888        0
SNP9        60.888        3
SNP10        60.888        0
SNP11        60.888        0