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新手求助 关于 哈希的 用法 [复制链接]

古城黑巷烂少年

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1楼 [收藏(0)] [报告]
发表于 2015-07-23 10:45 |只看该作者 |倒序浏览
这样一个fasta的文件，如何以名字为key而序列为value赋值一个哈希。。。
>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:2641:2564
GCCGCCACGGCCGGCCATGTCCTCGAGGCGGCGGATTCGGTCGGCGATCGGCGGGGGGGGCGGAGAGAAGCGTTCAAAGCGTTTGGCGGCGCGGAAAGGAGGCTCGAAGAAGACACTACGGAACCC
>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:8113:2687
AGCTTCGTCGCGACTGTCAATTGCCTGGTTCAGTTGATCAATCCCGCTAAAGC
>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:5618:3854
GGCGGGTTCGGGGGGGCACTTTGGGGGCGTCACTACTCGGCTCGCGCCGTCGGTTTTTCACCCCTGAACCGACTCTTTGGGTCAAGCCAC
古城黑巷烂少年

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2楼 [报告]
发表于 2015-07-23 10:59 |只看该作者
麻烦大家了
实战分享：从技术角度谈机器学习入门| 【大话IT】RadonDB低门槛向MySQL集群下战书 | ChinaUnix打赏功能已上线！ | 新一代分布式关系型数据库RadonDB知多少？
古城黑巷烂少年

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3楼 [报告]
发表于 2015-07-23 20:28 |只看该作者
查了一天的资料总算解决了。。
实战分享：从技术角度谈机器学习入门| 【大话IT】RadonDB低门槛向MySQL集群下战书 | ChinaUnix打赏功能已上线！ | 新一代分布式关系型数据库RadonDB知多少？
sunzhiguolu

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程序设计版块每周发帖之星 日期:2016-04-08 00:41:33操作系统版块每日发帖之星 日期:2015-09-02 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-02 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-04 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-04 06:20:00每周论坛发贴之星 日期:2015-09-06 22:22:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-09 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-19 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-20 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-20 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-22 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-24 06:20:00
4楼 [报告]
发表于 2016-09-10 22:10 |只看该作者
  1. perl -0ne '{%h=map{split}split(/(?=\n>)/)}END{print "$_\n$h{$_}\n" for keys %h}' f
复制代码

>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:8113:2687
AGCTTCGTCGCGACTGTCAATTGCCTGGTTCAGTTGATCAATCCCGCTAAAGC
>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:5618:3854
GGCGGGTTCGGGGGGGCACTTTGGGGGCGTCACTACTCGGCTCGCGCCGTCGGTTTTTCACCCCTGAACCGACTCTTTGGGTCAAGCCAC
>HWI-D00621:199:HV72KADXX:2:1101:2641:2564
GCCGCCACGGCCGGCCATGTCCTCGAGGCGGCGGATTCGGTCGGCGATCGGCGGGGGGGGCGGAGAGAAGCGTTCAAAGCGTTTGGCGGCGCGGAAAGGAGGCTCGAAGAAGACACTACGGAACCC
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华小飞_Perl

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5楼 [报告]
发表于 2016-09-10 22:19 |只看该作者
fasta序列经常的操作是使用\n>作为行分隔符，之后对于id和序列就方便处理多了~
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