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[文本处理] 相关行的数据处理 [复制链接]

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发表于 2016-12-20 17:09 |只看该作者 |倒序浏览
本帖最后由 gooderpan 于 2016-12-20 17:15 编辑

有一个文件file:(tab分隔)
CASP8        ID:841  Predicted
BIOSYSTEM:169493  377873  1269170  213780
BIOSYSTEM:1270288  1270261  1270287

PIK3CD        ID:5293  Predicted
BIOSYSTEM:1269171  169493  373889

FCAR        ID:2204  Predicted
BIOSYSTEM:153910  153859  With_TAP2
BIOSYSTEM:171867  153910
BIOSYSTEM:153910  153859  With_HLA-B
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
以每个基因为每行的开头,将后续每行接入其后面,想要得到的结果如下:
CASP8        ID:841  Predicted  BIOSYSTEM:169493  377873  1269170  213780  BIOSYSTEM:1270288  1270261  1270287
PIK3CD        ID:5293  Predicted  BIOSYSTEM:1269171  169493  373889
FCAR        ID:2204  Predicted    BIOSYSTEM:153910  153859  With_TAP2    BIOSYSTEM:171867  153910  BIOSYSTEM:153910  153859   With_HLA-B
请问大神们,该怎么处理呢???谢谢啦!!

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发表于 2016-12-20 17:21 |只看该作者

  1. awk NF=NF RS= file
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发表于 2016-12-20 18:06 |只看该作者
  1. perl -00ne '@F=split(/\n/);print @F,"\n"' f
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发表于 2016-12-20 19:54 |只看该作者

  1. sed '/ID:/{:a;N;/\n\s*$/!{s/\n/ /;ta};P};D' file
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发表于 2016-12-20 19:58 |只看该作者
  1. perl -00pe 's/\n(?!\z)/\t/g' f
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发表于 2016-12-20 23:07 |只看该作者

  1. sed '/ID:/{h;d};H;$ba;/^\s*$/{:a;g;s/\n/ /gp};d' file
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发表于 2016-12-21 00:03 |只看该作者
回复 5# sunzhiguolu
请问大神,这个perl命令的含义是什么呀??

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回复 7# gooderpan
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  1. awk 'BEGIN{RS=""}{$1=$1;print}' file

  2. sed '/ID/{:a;N;/\nBIOSYSTEM/s/\n/ /;ta;P;D}' file
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