TypeError: string indices must be integers, not str [复制链接]

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发表于 2017-01-19 16:56 |只看该作者 |倒序浏览

本帖最后由 gooderpan 于 2017-01-19 17:10 编辑

Code.zip (10.99 KB, 下载次数: 3)

附件是程序和测试文件，我使用的命令是：python vcf2maf.py -v --maf BJ.maf BJ.test.vcf

但是最后报错了，显示内容为：

Traceback (most recent call last):

File "vcf2maf/vcf2maf.py", line 556, in <module>

main()

File "vcf2maf/vcf2maf.py", line 543, in main

n += vcf2maf(vcf_file, maf_file, decrement_end_coordinate=args.decrement_end_coordinate, verbose=args.verbose)

File "vcf2maf/vcf2maf.py", line 188, in vcf2maf

ncbi_build = vcf_reader.metadata['reference']['ID'].split(' ')[0]

TypeError: string indices must be integers, not str

请问大神，这个程序是哪里错了呀？？我应该怎么改呀？？(运行此python需要提前安装依赖包：PyVCF)