按照某列信息合并两个文件

绵羊不爱吃羊

要根据第四列的信息合并两个文件，内容如下：
test1.bed
chr15   55943670        55943692        ST-E00104:390:H7F5MALXX:3:1101:1661:38192       25      +
chrX    12356      12409    ST-E00104:390:H7F5MALXX:3:1101:1661:38282       25      -
chr1    102356      102400    ST-E00104:390:H7F5MALXX:3:1101:1662:30082       25      -
test2.bed
chr12    104356      104408    ST-E00104:390:H7F5MALXX:3:1101:1662:30082       25      -
chr7    14452356      14452401    ST-E00104:390:H7F5MALXX:4:1101:1661:38210       25      +
最后的输出格式是：
chr1    102356      102400   chr12    104356      104408    ST-E00104:390:H7F5MALXX:3:1101:1662:30082

文件的行数很多，希望能够尽可能提高效率。
感谢大家的帮助。

q1208c

回复 1# 绵羊不爱吃羊

建议先把两个文件放在一起按第四列排序。
然后再把相同的两行输出。

不过，我真不觉得效率能高多少，如果两个文件都有很多行的话。

ouyixq

Don't undermine your worth by comparing yourself and others.

ouyixq

Don't undermine your worth by comparing yourself and others.

zxy877298415

回复 1# 绵羊不爱吃羊

不知道文本中有没有重复值！

1. awk 'FNR==NR{a[$4]=$1" "$2" "$3;next}a[$4]{b[$4]=a[$4]" "$1" "$2" "$3}END{for(i in b) print b[i],i}' test1.bed test2.bed

复制代码

wh7211

回复 1# 绵羊不爱吃羊

1. awk 'FILENAME==ARGV[1]{a[$4]=$1" "$2" "$3" "$4;next}{if(a[$4]){print $1,$2,$3,a[$4]}}' test2.bed test1.bed

复制代码

绵羊不爱吃羊

没有重复数据，我已经去过重了 这个代码可以用，感谢您的帮助回复 6# zxy877298415

龙牙地主天

1. awk 'NR==FNR{a[$4]=$1 FS $2 FS $3 ; next}{if(a[$4]) print a[$4],$1,$2,$3,$4}' test1 test2

复制代码

绵羊不爱吃羊

awk 'FNR==NR{a[$4]=$1" "$2" "$3;next}a[$4]{b[$4]=a[$4]" "$1" "$2" "$3}END{for(i in b) print b,i}' test1.bed test2.bed
想问一下 这里的a[$4]是什么意义（黄色高亮的部分）回复 6# zxy877298415