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[文本处理] 统计每一行中大于某个值的个数 [复制链接]

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1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2018-08-29 11:01 |只看该作者 |倒序浏览
原数据格式如下:一共5列


chr pos1 total_cov_S9 total_cov_S10 total_cov_S11
chr1 10489 NA NA 3
chr1 10493 NA 7 3
chr1 10497 44 27 104
chr1 10525 9 NA 104
chr1 10542 NA 28 NA




想在每一行后添加一列,统计后三列中大于10的个数,最后结果应该是下面这样

chr pos1 total_cov_S9 total_cov_S10 total_cov_S11
chr1 10489 NA NA 3 0
chr1 10493 NA 7 3  0
chr1 10497 44 27 104  3
chr1 10525 9 NA 104  1
chr1 10542 NA 28 NA   1


请问该怎么写?

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2016科比退役纪念章
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发表于 2018-08-29 11:29 |只看该作者
  1. gawk 'NR>1{c=0;for(i=3;i<=NF;i++){if(int($i)>10) c++}}{print $0,c}' file
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3 [报告]
发表于 2018-08-29 14:56 |只看该作者
本帖最后由 christmas1102 于 2018-08-29 15:03 编辑
  1. awk 'NR>1{a=0;for(i=NF-2;i<=NF;i++){if(int($i)>10){a++}}}{print $0,a}' file
复制代码
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