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biobaby

各位大家好，我有一个文件如下:

chr1   1     -    a
chr1   2     -    b
chr2   1     -    c
chr2   2     -    d
chr2   3     -    e
chr2   4     -    f
chr3   1     -    g
chr3   2     -    h
chr3   3     -    i
chr4   1     -    j

想要得到下边的结果：
chr1   2     -    a
chr1   1     -    b
chr2   4     -    c
chr2   3     -    d
chr2   2     -    e
chr2   1     -    f
chr3   3     -    g
chr3   2     -    h
chr3   1     -    i
chr4   1     -    j

就是对于第一列相同的第二列 反着排输出， 比如对于chr2   第二列一次是1,2,3,4 输出结果需要第二列是4,3,2,1，第三列保持不变


请问各位如何实现？
谢谢

haooooaaa

好恶心...

1. $ sort -k1.1,1.4 -k2nr a | awk -vOFS="\t" '{"cat a"|getline line;split(line,t);print $1,$2,t[3],t[4]}'
   
2. chr1    2       -       a
   
3. chr1    1       -       b
   
4. chr2    4       -       c
   
5. chr2    3       -       d
   
6. chr2    2       -       e
   
7. chr2    1       -       f
   
8. chr3    3       -       g
   
9. chr3    2       -       h
   
10. chr3    1       -       i
    
11. chr4    1       -       j
    

复制代码

ly5066113

回复 1# biobaby

1. paste file <(sort -k1,1 -k2nr file) | awk -vOFS="\t" '{$2=$6}NF=4'

复制代码

biobaby

聪明！
回复 3# ly5066113


   

jason680

回复 1# biobaby

$ awk -vOFS="\t" 'function p(){if(c++)for(n=1;n<c;n++)print s,a[2,c-n],a[3,n],a[4,n];c=0}{if($1!=s)p();c++;s=$1;a[2,c]=$2;a[3,c]=$3;a[4,c]=$4}END{p()}' FILE
chr1    2    -    a
chr1    1    -    b
chr2    4    -    c
chr2    3    -    d
chr2    2    -    e
chr2    1    -    f
chr3    3    -    g
chr3    2    -    h
chr3    1    -    i
chr4    1    -    j

   

tuyajie

paste <(awk '{print $1,$2}' test.txt | sort -k 1,1 -k 2nr) <( awk '{print $3,$4}' test.txt)

yinyuemi

回复 1# biobaby

1. sed -nr '1!{G;/^(chr[^ ]+).+\n\1/!{h;s/^[^\n]+\n//p;g;s/\n.+//}};h;$p'
   

复制代码

聆雨淋夜

明显是sort的菜
sort -k1.4,1n -k2,2nr file
chr1   2     -    b
chr1   1     -    a
chr2   4     -    f
chr2   3     -    e
chr2   2     -    d
chr2   1     -    c
chr3   3     -    i
chr3   2     -    h
chr3   1     -    g
chr4   1     -    j

MMMIX

回复 8# 聆雨淋夜


    第四列要原样输出不动的。

聆雨淋夜

回复 9# MMMIX
眼花了，我说各位大神怎么写这么复杂