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1楼 [收藏(0)] [报告]

发表于 2015-09-02 16:18 |只看该作者 |倒序浏览

文件123.txt 格式如下：
CHROM 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 10 110 111 112 113 114
1 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:8,6,0:7 1/1:0,0,0:3 1/1:46,6,0:8 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3
2 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:4,3,0:8 0/0:0,0,0:9 0/0:0,6,46:15 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9
3 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/1:40,3,0:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,3,4:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,6,46:16 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10
4 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,3,40:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,3,4:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,6,46:16 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10
5 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,3,40:8 0/0:0,0,0:6 0/0:4,3,0:5 0/0:0,0,0:6 0/1:46,6,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6
6 1/1:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 1/0:0,3,40:9 1/0:0,0,0:6 1/0:0,3,4:8 1/0:0,0,0:6 0/1:0,6,46:11 0/1:0,0,0:6 1/1:0,0,0:6 1/1:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 0/1:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6
如何统计每行出现的 0/0的次数，并把出现0/0次数大于8的行删除？请指教！谢谢！
统计完删除后的文本new。txt是这样的：
CHROM 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 10 110 111 112 113 114
1 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:8,6,0:7 1/1:0,0,0:3 1/1:46,6,0:8 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3
6 1/1:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 1/0:0,3,40:9 1/0:0,0,0:6 1/0:0,3,4:8 1/0:0,0,0:6 0/1:0,6,46:11 0/1:0,0,0:6 1/1:0,0,0:6 1/1:0,0,0:6 1/0:0,0,0:6 0/1:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6

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2楼 [报告]

发表于 2015-09-02 16:23 |只看该作者

本帖最后由 haooooaaa 于 2015-09-02 17:29 编辑

awk 'split($0,t,"0/0")<=9' c

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hjfeng1988	+ 10	赞一个!

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3楼 [报告]

发表于 2015-09-02 16:43 |只看该作者

你好！刚才测试了一下，第7行还是删除了，只保留了前两行，请问怎样再改进一下？回复 2# haooooaaa

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辰龙
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4楼 [报告]

发表于 2015-09-02 17:10 |只看该作者

回复 2# haooooaaa

[root@66a awk]# cat file
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 7
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 8
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 9
[root@66a awk]# awk 'split($0,t,"0/0")<=9' file
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 7
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 0/0 8
[root@66a awk]#

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发表于 2015-09-02 17:29 |只看该作者

回复 4# hjfeng1988

谢谢.

确实应该加1, 类似 "a b" 按空格split就应该是 1+1 个元素

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发表于 2015-09-07 15:48 |只看该作者

awk 'gsub(/0\/0/,"")<8'

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发表于 2015-09-07 16:10 |只看该作者

怎么都用 split ，直接 -F 不就可以了么？

awk -F '0/0' 'NF<=9' file

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hjfeng1988		+ 10	赞一个!忘记了
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