如何对文本内容拆分并编辑

怿_mao44

输入文件是成千行记录的文本文件，下面是截取的两行记录：

1. 592        NM_001142467        chr1        -        934343        935552        934438        935353        3        934343,934905,935071,        934812,934993,935552,        0        HES4        cmpl        cmpl        1,0,0,
   
2. 592        NM_021170        chr1        -        934341        935552        934438        935353        4        934341,934905,935071,935245,        934812,934993,935167,935552,        0        HES4        cmpl        cmpl        1,0,0,0,

复制代码

希望获得的结果是将，每一行的第10,11列，按照“,”进行拆分后，分别相互配对，每一列包含的由“,”拆分区间个数不定，数目为第9列数值

输出结果中，第1~3，7列为输入文件的2~4，13列，没有做修改，只是第4,5列是原输入文件第10,11列按顺序依次拆分后的结果

1. NM_001142467        chr1        -        1        934343        934812        HES4
   
2. NM_001142467        chr1        -        2        934905        934993        HES4
   
3. NM_001142467        chr1        -        3        935071        935552        HES4
   
4. NM_021170        chr1        -        1        934341        934812        HES4
   
5. NM_021170        chr1        -        2        934905        934993        HES4
   
6. NM_021170        chr1        -        3        935071        935167        HES4
   
7. NM_021170        chr1        -        4        935245        935552        HES4

复制代码

jiejie455

菜鸟抛板砖：

1. awk '{split($10,a,",");split($11,b,",");for(i=1;i<length(a);i++){print $2"\t"$3"\t"$4"\t"i"\t"a[i]"\t"b[i]"\t"$13}}' data

复制代码

dahaoshanhe

没看的太明白 再简化下例子行么

怿_mao44

回复 3# zooyo


       不是作业呐。。没有什么时候要交
    是想对自己之前一个结果进行复查
之前是用笨方法，比较区间起始终止，计算两个位置文件之间的重叠长度记录，很多地方是自己手动计算，这里想能不能有准确性高一点的方法

   这里就是对位置文件中位置信息的提取过程

怿_mao44

回复 4# jiejie455


    试试先。。
你如果还说自己菜鸟，我都要无地自容了。。

   当时我是用“,”做分隔符，再换成换行符这样单独提取某一个记录中的小区间，记录多的时候就懵了。。

su8610

等着解决办法，学习学习