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楼主: jiangphoenix
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perl编程:关于bed文件制作求助 [复制链接]

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日期:2014-12-12 10:55:00
11 [报告]
发表于 2016-09-14 13:03 |只看该作者
回复 10# sunzhiguolu

就是将图中的那三行 合并成一行

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12 [报告]
发表于 2016-09-14 13:07 |只看该作者
回复 11# jiangphoenix
关键是那张图我看不见啊!!!



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日期:2014-12-12 10:55:00
13 [报告]
发表于 2016-09-14 13:07 |只看该作者
回复 10# sunzhiguolu



这两行上面第三列 和下面第二列的坐标很接近,我想把这俩段区域合并成一个区域 类似于结果chr1 11132850 11132939 就是合并行

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日期:2014-12-12 10:55:00
14 [报告]
发表于 2016-09-14 13:08 |只看该作者
回复 12# sunzhiguolu

chr1 11129265 11129312
chr1 11132717 11132739
chr1 11132741 11132745
chr1 11132747 11132764
chr1 11132766 11132818

chr1 11132850 11132904
chr1 11132906 11132939
chr1 11139743 11139968
chr1 11150021 11150225
chr1 11172370 11172752
chr1 11174848 11175076
chr1 11175999 11176441
chr1 11177029 11177309
chr1 11177311 11177397
chr1 11177453 11177683
chr1 11181703 11182355
chr1 11187182 11187371
chr1 11193359 11193591
chr1 11195078 11195149


就是这个数据格式

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发表于 2016-09-14 13:09 |只看该作者
本帖最后由 sunzhiguolu 于 2016-09-14 13:10 编辑

将你的想要的结果贴出来 特殊的地方加个注释, 谢谢! 我这里实在是看不见你上传的图片!

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发表于 2016-09-14 13:16 |只看该作者
本帖最后由 sunzhiguolu 于 2016-09-14 13:19 编辑

回复 14# jiangphoenix
chr1 11129265 11129312
chr1 11132717 11132739
chr1 11132741 11132745
chr1 11132747 11132764
chr1 11132766 11132818

chr1 11132850 11132904
chr1 11132906 11132939
chr1 11139743 11139968
chr1 11150021 11150225
chr1 11172370 11172752
chr1 11174848 11175076
chr1 11175999 11176441
chr1 11177029 11177309
chr1 11177311 11177397
chr1 11177453 11177683
chr1 11181703 11182355
chr1 11187182 11187371
chr1 11193359 11193591
chr1 11195078 11195149

请把上面数据的处理结果贴出来看下

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日期:2014-12-12 10:55:00
17 [报告]
发表于 2016-09-14 13:21 |只看该作者
回复 16# sunzhiguolu
结果就是这个样子的:

chr1 11129265 11129312
chr1 11132717 11132739
chr1 11132741 11132745
chr1 11132747 11132818
chr1 11132850 11132904
chr1 11132906 11132939
chr1 11139743 11139968
chr1 11150021 11150225
chr1 11172370 11172752
chr1 11174848 11175076
chr1 11175999 11176441
chr1 11177029 11177309
chr1 11177311 11177397
chr1 11177453 11177683
chr1 11181703 11182355
chr1 11187182 11187371
chr1 11193359 11193591
chr1 11195078 11195149

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发表于 2016-09-14 13:24 |只看该作者
本帖最后由 sunzhiguolu 于 2016-09-14 13:27 编辑

回复 17# jiangphoenix
合并的依据是什么?

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发表于 2016-09-14 13:27 |只看该作者
回复 18# sunzhiguolu

是的,就是想把这几个上下两个距离很近的区域合并起来

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发表于 2016-09-14 13:32 |只看该作者
回复 19# jiangphoenix
你的这个示例似乎与最初的题目要求有些不同, 处理条件需要具体说下. (如果是未处理过的数据的话)

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