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vasp 旋转坐标轴 理想强度

现在在学vasp,有一个问题想向大家请教:在RUN vasp时出现了以下的错误.但是我同样的4个输入文件,没有任何改动,提交2次,它会在不同的地方出现这样的错误(而且有时一次出现这样的错误,但是另外一次却成功了),不知道是不是MPI或者体系大小的问题?在网上搜了一下这个错误,好象是和MPI有关,但是我看不明白,谢谢! 错误: rank 2 in job 1 h0105_46637 caused collective abort of ranks exit ststus of rank 2:return code 41 本...

by sbtang - Linux文档专区 - 2008-08-28 09:40:14 阅读(899) 回复(0)

相关讨论

量子化学网 http://new.quantumchemistry.net/Experience/CommonSoftwares/vasp/CompileInstallation/Index.html 水草树 http://mifunny.info/install-vasp-for-linux-112.html Intel提供的编译 http://support.intel.com/support/performancetools/libraries/mkl/sb/CS-028850.htm 本文来自ChinaUnix博客,如果查看原文请点:http://blog.chinaunix.net/u2/84821/showart_1387639.html

by cos60 - Linux文档专区 - 2008-11-08 15:50:10 阅读(962) 回复(0)

分享】自己的Makefile http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1505086&fpage=1 【转帖】vasp 初学者必读 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1495152&fpage=1 【原创】vasp关键词详解 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1489704&fpage=1 【原创】core i7 编译运行vasp http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1500509&fpage=1 【讨论】vasp编译方法以及错误汇总 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1354...

by 冰海里的一条鱼 - Linux文档专区 - 2010-01-13 15:52:02 阅读(2867) 回复(0)

Compilation of vasp on Opteron/Rocks cluster Ametisti with Pathscale 2.2.1 Fortran compilerThese observations apply to the serial version of vasp. The parallel section dealing with vasp on Ametisti using the MPI interface will be included later. I used the makefile from Janne Blomqvist at Helsinki University of Technology (Thanks Janne). Few things were noticed after a successful compilation. Se...

by beyondstar - Linux文档专区 - 2009-02-21 14:24:08 阅读(767) 回复(0)

POTCAR 赝势文件 可以理解为分子力学模拟中的力场文件 但包括的信息更多 vasp4.6将各元素优化的INCAR里的参数也包括在这里了,作为支持PREC的缺省选择 通常各元素的POTCAR已经包括在软件包里了 我们只需要按照POSCAR里的顺序,将各元素的POTCAR按顺序连接起来就可以了 如以下命令: cat file1 file2 file3 > POTCAR 软件包自带的绝大多数赝势是超软赝势(US-PP)了,但不少元素有两个版本,如何 选...

by laobeifeng - Linux文档专区 - 2008-04-23 21:06:41 阅读(1093) 回复(0)

http://new.quantumchemistry.net/Experience/CommonSoftwares/vasp/Index.html 本文来自ChinaUnix博客,如果查看原文请点:http://blog.chinaunix.net/u2/65114/showart_569845.html

by laobeifeng - Linux文档专区 - 2008-04-20 10:58:17 阅读(614) 回复(0)

我们用Pd金属作为例子。 Pd金属的实验上的晶格常数为3.89A。在这里,我们用vasp计算它的晶格常数。 首先将Pd所对应的POTCAR文件拷贝到目录下。然后准备好INCAR和KPOINTS文件。POSCAR文件我们将通过一个tcsh的script来产生。 KPOINTS文件可以如下: Monkhorst Pack 0 Monkhorst Pack 11 11 11 0 0 0 INCAR文件可以如下: SYSTEM = Pd bulk calculation Startparameter for this run: PREC = Accurate ...

by laobeifeng - Linux文档专区 - 2008-04-20 10:41:58 阅读(1136) 回复(0)

在文献中,经常见到利用电荷密度差(charge density difference)来分析成键的过程或是结构弛豫前后电荷的转移,当然,也有人用来分析基态和激发态的电荷分布差别等情况。不过,尽管似乎都叫“电荷密度差”,但具体的定义是不大一样的。 这里主要是讨论在vasp中如何得到用来分析成键前后电荷转移的电荷密度差。 此时电荷密度差定义为: delta_RHO = RHO_sc - RHO_atom 其中 RHO_sc 为自洽的面电荷密度,而 RHO_atom 为相应的...

by 冰海里的一条鱼 - Linux文档专区 - 2009-11-02 09:59:22 阅读(1767) 回复(0)

POSCAR = position + CAR 第1行:任意文字注释 第2行:晶格常数,单位A,后面所有的长度值得自原值除以此值 a=b=c时取a即可,否则个人习惯取三者最大 若取负值,则为晶胞体积,单位A3 第3-5行:定义晶矢 参见《固体量子化学——材料化学的理论基础》赵成大 如 对于正交晶体 a=20.022 b=19.899 c=13.383 α=β=γ=90 可以这样定义 20.022 1.00000 0.00000 0.00000 0.0000...

by laobeifeng - Linux文档专区 - 2008-04-23 21:40:13 阅读(1560) 回复(0)

以下的的问题是vasp初学者经常遇到的,列出来共同讨论: 1.TEBEG,TEEND的单位是K吗? 答:是K为单位的。 2.在运算中,直接COPY POSCAR文件到工作目录就可以吗,用不用再POSCAR或INCAR文件中设定参数来控制POSCAR的赝势的选取方法? 答:不大明白你的问题。在一个工作目录准备好INCAR,POSCAR,POTCAR,KPOINTS这四个文件。先看POTCAR中LEXCH后面的值 是什么,如果是CA,那么INCAR中就不用设置G...

by laobeifeng - Linux新手园地 - 2008-04-23 21:33:43 阅读(2816) 回复(0)

在计算中,交换关联势的选取取决于用什么形式的POTCAR。通常可以通过看POTCAR文件的header部分来知道是什么形式的赝势. POTCAR文件: ------------------------------------------- LEXCH = 91 ------------------------------------------- 比如LEXCH = 91代表GGA的是PW91形式的交换关联势。在INCAR文件中,通常不需要另外指定GGA tag。vasp会自动根据你选取的 POTCAR文件来设置GGA tag. 在vasp的帮助文件中有如下的文字 "it is ...

by laobeifeng - Linux文档专区 - 2008-04-23 21:13:00 阅读(1137) 回复(0)